Projekta nosaukums latviski: Novatoriskas pieejas izstrāde, lai identificētu bioloģiskos noteicošos faktorus, kas saistīti ar dzīvnieku barības efektivitātes atšķirībām aitkopībā
Projekta nosaukums angliski: Development of an innovative approach to identify biological determinants involved in the between-animal variation in feed efficiency in sheep farming
Projekta numurs: lzp-2021/1-0489
Projekta īstenotājs: Latvijas Universitāte (LU)
Projekta sadarbības partneris: Latvijas Lauksaimniecības universitāte (LLU)
Projekta vadītāja: Dr.med. Ilva Trapiņa
Projekta īstenošanas vadošā struktūrvienība LU ir Bioloģijas institūts
Projekta īstenošanas periods: 03.01.2022. – 30.12.2024.
Projekta kopējais finansējums: 299 999,70 EUR, tajā skaitā LU projekta daļai piešķirtais finansējums: 232 239,70 EUR
Informācija par projektu:
Barība veido 65–70% no aitkopības izmaksām, un tāpēc barības efektivitātes uzlabošana ir svarīga ekonomikai un videi. Zema barības efektivitātes BE negatīvi ietekmē vidi (palielināts nepieciešamo barību apjoms un arī gāzu izmeši dzīvniekam) un palielina ražošanas izmaksas aitu audzētājiem. Pētījumos ir pierādīts, ka efektīva barības pārstrāde dzīvniekiem samazina barības izmaksas, neietekmējot augšanu un gaļas kvalitāti, bet samazina barības uzņemšanu svaru un barošanas ilgumu, kā arī samazina metāna un kūtsmēslu ražošanu. Tādejādi tiek uzlabots aitu audzētāju izmaksas par vienas vienības uzturēšanu/audzēšanu.
Iepriekšējā partneru pētījumā par Latvijas aitu šķirņu un to krustojumu piemērotību kvalitatīviem liemeņiem un gaļai tika konstatēts, ka vislielākā augšanas intensitāte jēriem 70-90 dienu (2-3 mēnešu) vecumā nobarošanā bija Sufolkas šķirnei, vairāk nekā 450 g dienā, līdzīgi rezultāti intensīvām gaļas šķirnēm Šarolē, Ildefransā un citās. Ja ir lielāks augšanas ātrums, tad, lai iegūtu dzīvmasas pieaugumu, patērē mazāk kombinētās barības. Tomēr pētījumā tika secināts, ka nobarošanas intensitāte var atšķirties ne tikai vienas šķirnes ietvaros, bet pat viena metiena jeb viena vecāku jēriem ietvaros. Tātad ir kāds iekšējas mehānisms, kas to regulē.
Projektā plānotais rezultāts, ja apstiprināsies izteiktā hipotēze un plānotie pētījuma primārie rezultāti, būs pamats barības efektivitātes marķieru noteikšanas metodes izstrādei, pamatojoties uz fenotipiskajām īpašībām un molekulārajiem un ģenētiskajiem marķieriem, kas iegūti no dzīvu jēru asins analīzēm. Iegūto metodi varēs izmantot gan aitkopji izvēloties teķus (aunus) selekcijai, gan izvērtējot jēru barības efektivitāti. Izmantojot sasniegtos rezultātus praksē, tiks uzlabota tieši Latvijas nacionālā šķirne – Latvijas tumšgalve, jo pētīto paraugu lielākā daļa būs tieši no šīs šķirnes.
Lai izveidotu projektā paredzēto metožu aprakstus un tehnisko rīkus, ko izmanto aitu audzēšanas selekcijā un aitkopības izmaksu samazināšanai jeb jēru barības efektivitātes uzlabošanai, tiks analizēti intensīvi nobarotu jēru fenotipiskie rādītāji, asins bioķīmiskie rādītāji, molekulārās bioloģijas rādītāju (gēnu ekspresiju, gēnu mutācijas) saistība ar barības efektivitāti konkrētā laika periodā, sasniedzot noteiktu masu. Izmantojot iegūtos rezultātus tiks izstrādāti ieteikumi un prognozēšanas rīks.
Sadarbības partneris ir LLU pētnieku grupa, kurai ir pieredze sabalansētas ēdināšanas aitu audzēšanā, audzēšanas izmēģinājumos, aitu produkcijas kvalitātes pētīšanā, kā arī pieredze jēra gaļas fenotipisko īpašību saistīšanai ar gaļas kvalitāti. LLU pētnieku grupa jau vairākus gadus sadarbojas ar Latvijas aitu audzētāju asociāciju (LAAA).
Praktizējošu lauksaimniecības speciālistu dalībai projektā, pētījuma rezultātus varēsim nodot tieši aitu audzētājiem, tādējādi veicinot iegūtās metodikas ieviešanu praksē. Kā arī plānotas 2 zinātniskās starptautiskās publikācijas, 2 zinātniskās publikācijas Latvijas žurnālos, 1 intelektuālā īpašuma licences vai nodošanas līgums un dalība vairākās konferencēs.
Zinātniskā grupa:
No LU zinātniskā vadītāja/ pētniece Dr.med. Ilva Trapiņa, vadošā pētniece/ galvenā izpildītāja Dr.biol. Natālia Paramonova, vadošā pētniece/ izpildītāja Dr.med. Elīna Leonova, izpildītāji (studējošie): zinātniskā asistente Samanta Pļaviņa, pētnieks Nikole Krasņevska, pētniece Anda Miķelsone, laborants Jegors Paramonovs.
No LLU Profesore, Dr. agr. Daina Kairiša, laborants Andris Bērziņš.
Papildus informācija par projektu: https://www.facebook.com/FeedEfficiencySheep
Projektā paveiktais:
Projekta pirmajā ceturksnī ir sagatavoti visi projekta realizēšanas dokumentācija, tai skaitā noslēgts sadarbības līgums starp LU un projekta partneriem LLU. Ir novadītas abu projektu sadarbības pušu komandu tikšanās, lai pārrunātu projekta gaitu. Kā arī ir izsludināta cenu aptauja par aitu asins paraugu bioķīmisko analīzi, kas ir veiksmīgi noslēgusies ar noslēgtu līgumu.
Jau ir uzsākta aitu jēru nobarošanas Latvijas Aitu asociācijas stacijā Klimpas. Pirmie 6 asins paraugu komplekti ir nogādāti LU un LLU laboratorijās DNS un RNS izdalīšanai, kā arī uz bioķīmisko analīzi, kuras pirmie rezultāti ir saņemti un ievadīti datu bāzē.
Tiek precizēta informācija par projektā plānoto aitu gēnu sekvencēm un struktūru, lai sagatavotos Jaunās paaudzes sekvencēšanas (NGS; New generation sequencing) procesam un RNS ekspresijas analīzei.
Ir sniegta pirmā prezentācija par projektu LU konferences Bioloģijas institūta sēdē. Prezentācijā tika sniegts ieskats sagaidāmajos rezultātos un veidota diskusija ar klātesošajiem par sagaidāmo rezultātu nozīmīgumu.
Projekta otrajā ceturksnī turpinās jaunu jēru nobarošana aitu audzēšanas stacijā. Līdz ceturkšņa beigām ir izveidota aitu paraugu kolekcija ar 31 paraugu, kam ir veikta bioķīmijas analīze un izdalīts DNS un RNS.
Ceturkšņa sākumā ir saņemti pilnībā pirmo sešu asins paraugu komplektu pilnīga bioķīmiskā analīze. Tā rezultātā ir secināts, ka bioķīmiskās analīzes rezultāti ir kā plānoti katram dzīvniekam. Paralēli bioķīmisko analīžu rezultātu saņemšanai, tika analizēta zinātniskās publikācijas un specifiskā literatūra, lai sagatavotu analizēto bioķīmisko lielumu sagaidāmos diapazonus un normas.
Projekta dalībnieki turpina veidot zinātnisko publikāciju bibliotēku, ko varēs izmantot publikāciju un prezentāciju sagatavošanai.
Tiek turpināts darbs pie NGS un RNS ekspresijas protokolu sagatavošanas, reaģentu cenu apzināšanas un darba procesa sagatavošanu.
Sadarbībā ar Illumina darbiniekiem ceturkšņa ietvaros ir izveidots amplikonu saraksts, lai projekta ietvaros veiktu Jaunās paaudzes sekvencēšanu un aptvertu 99,18% no plānotajiem 10 gēnu reģioniem. Paralēli ir sākts iepirkuma līguma sagatavošana/noslēgšana ar Illumina, lai realizētu paredzētos uzdevumus.
Ceturkšņa sākumā projekta vadītāja Ilva Trapiņa piedalījās kā klausītāja Pasaules kongresā par lopkopības ģenētiku (World Congress on Genetics Applied to Livestocks Production).
Projekta trešajā ceturksnī turpinās jaunu jēru nobarošana aitu audzēšanas stacijā. Līdz ceturkšņa beigām ir izveidota aitu paraugu kolekcija ar 76 paraugiem, kam ir veikta bioķīmijas analīze un izdalīts DNS un RNS. Šie paraugi veido pilnu 1. gada kolekciju, jo nobarošanas stacijā ir pabeigta nobarošana. Papildus tika nolemts, ka atlikušajos 24 paraugos tiks apkopoti asins paraugi no teķiem (aitu tēviņiem) un jēriem no saimniecībām.
Bioķīmijas analīzes dati ir ietverti kopējā datu bāzē un veikta pirmējā apskates analīze, kurā secināts, ka viena hormona analīze turpmāk (sākot no 60 parauga) vairs nav vajadzīga.
Kā arī turpinās darbs pie galējā datu bāze nobarošanas datiem.
Tiek turpināts darbs pie RNS ekspresijas protokolu sagatavošanas, reaģentu cenu apzināšanas un darba procesa sagatavošanas.
Ir noslēgts sadarbības līgums ar Illumina un veikts pasūtījums, lai varētu veikt 10 gēnu sekvencēšanu pilnai pirmā gada kolekcijai.
Ir noslēdzies 2022. gada jeb projekta 1. gada kolekcijas grupas komplektēšana, ietverot grupā 76 nobarošanas jēru bioloģisko materiālu, kā arī papildus saņemot 14 nobarošanas jēru teķu ( kopumā grupā jēri ir no 22 teķiem) un 24 jērus (pus-sibus nobarošanas grupas jēriem) no saimniecībām.
Ceturkšņa sākumā tika veikts pasūtījums un saņemts sūtījums no Illumina ar projektā nepieciešamajiem reaģentiem 10 gēnu sekvencēšānai. Paralēli ir pabeigts DNS paraugu izdalīšana (kopumā pamatkolekcijā ir 76 paraugi) un to sagatavošana sekvencēšanai. Ir sākts darbs pie sekvencēšanas procesa: pirmais posms ir sekvencēšans bibliotēkas sagatavošana, kam rezultāti tiek plānoti 2023. gadā janvārī.
Ir izstrādāti RNS ekspresijas praimeri un protokoli, kā arī uzsākts RNS izdalīšana.
Saņemot informāciju no Latvijas Biozinātņu un tehnoloģijas universitātes (LBTU) kolēģiem par jēru nobarošanas mērījumiem, ir veikti pirmējie parēķini, lai noteiktu barības efektivitātes rādītāju sadalījumu starp jēriem, tos iedalot gan pēc šķirnes, gan pēc teķiem. Balstoties uz šiem aprēķiniem, tiek gatavotas jaunas prezentācijas (abstrakti) un publikācijas.
Ceturkšņa ietvaros projekta dalībnieki piedalījās XIX Baltic Animal Breeding Conference" Tartū, Igaunijā, ar mutisko prezentāciju “The difference of Latvian breed rams in terms of feed efficiency as an opportunity for genomic selection”, kurā tika prezentēti pirmie fenotipiskie un barības pārstrādes efektivitātes aprēķinu dati par projekta 2022. gada kolekcijas grupā ietvertajiem Latvijas Tumšgalves jēriem un to teķiem.
Kā arī ir iesniegts un saņemts apstiprinājums diviem abstraktiem uz “Biosystems Engineering 2023” konferenci maijā Tartū, Igaunijā. Uz abu abstraktu bāzes tiks veidotas zinātniskās publikācijas rakstu kopumam konferences ietvaros.
Ir saņemti 10 gēnu sekvencēšanas rezultāti, kuri ir sākti analizēt. Analīzes rezultātā tiks iegūta informācija par variabliem lokusiem gēnos un tie tiks analizēti saistībā ar jēru fenotipiskajiem rādītājiem. Viena gēna rezultāti ir izanalizēti lielākajā paraugu grupā jeb Latvijas tumšgalves jēriem.
Turpinās darbs pie 2022. gada kolekcijas paraugu RNS analīzēm.
Ir uzsākta 2023. gada jēru nobarošana un pirmo asins paraugu noņemšana, kurai paralēli ir veikta cenu aptauja un uzsākta līguma noslēgšana par asins bioķīmiskajām analīzēm.
Ir iesniegti divi abstrakti uz konferencēm “1st Central-Eastern European EAAP Regional Meeting” un “VIII Baltic Genetics Congress”. Abās konferencēs ir iesniegti zinātniskie dati par DNS analīzēm.
Ir iesniegti trīs abstrakti V Pasaules latviešu zinātnieku kongresam, norādot ne tikai iegūtos rezultātus, bet arī nozīmīgumu Latvijas tautsaimniecībai.
Projekta vadītāja piedalījās ar diviem ziņojumiem: “Report on the project's first year “Development of an innovative approach to identify biological determinants involved in the between-animal variation in feed efficiency in sheep farming”” un “Difference of Latvian dark-headed rams according to lamb fattening data and feed efficiency indicators” Latvijas Universitātes 81. zinātniskās konferences Bioloģijas institūta sēdē “Innovative and Applied Research in Biology”.
Ceturkšņa ietvaros ir iesniegtas divas zinātniskās publikācijas žurnālā “Agronomy”, kurā būs speciālais izlaidums konferencei “Biosystems Engineering 2023”.
Sadarbībā ar Latvijas Universitātes Statistiskas un matemātikas laboratoriju ir novadīts starp laboratoriju seminārs ar prezentāciju “Aitu barošanas efektivitātes rādītāju iedzimtības noteikšana ar dzīvnieku modeļiem”. Semināra mērķis ir paplašināt zināšanas un rast jaunu pieejamu prognozes algoritmu izstrādi.
Ceturkšņa ietvaros tiek pabeigts darbs pie NGS analīzes jeb ir izanalizēti visu 10 gēnu visu 76 pamatgrupas jēru sekvences. Kopumā 10 gēnos (5 visā sekvencē un 5 eksonu daļā) ir konstatēti 627 polimorfismi. Gandrīz puse no polimorfismiem ir konstatēti pilnīgā saistībā savā starpā jeb iegūtie rezultāti norāda uz pilnīgu nelīdzsvarotu saistību, bet atlikušie 328 lokusi ir novirzīti saistības analīzei ar barības efektivitātes rādītājiem, bioķīmijas rādītājiem un citiem nobarošanas procesā iegūtajiem rādītājiem.
Asociācijas jeb saistības analīze tiek veikta visiem paraugiem kopā un izdalot lielāko paraugu grupu jeb Latvijas tumšgalves jēru grupu. Viena gēna rezultāti ir izanalizēti un rezultāti tiek gatavoti publikācijai.
Turpinās darbs pie 2022. gada kolekcijas paraugu RNS un mitohondriāls DNS kopiju analīzēm.
Ir kopumā izveidota 2023. gada jēru kolekcija jau no 62 paraugiem, kuriem ir uzsākta DNS, RNS izdalīšana un veikta bioķīmiskā analīze.
Projekta dalībnieki ceturkšņa ietvaros piedalījās:
- VIII Baltic Genetics Congress ar stenda referātu par pirmajiem DNS analīzes rezultātiem.
- 1st Central-Eastern European EAAP Regional Meeting ar mutisko prezentāciju par pirmajiem DNS analīzes rezultātiem Latvijas tumšgalves šķirnes jēriem.
- Biosystems Engineering 2023 ar divām mutiskām prezentācijām par nobarošanas datiem.
- V Pasaules latviešu zinātnieku kongresā ar trīs stenda referātiem.
Ir publicētas divas WoSCC/Scopus raksti >=50% zinātniskās publikācijas:
- TRAPINA, D. Kairisa, N. Paramonova, Comparison of sire rams of the Latvian Dark-Head breed according to feed efficiency indicators as the beginning of genomic breeding research. Agronomy Research, 2023, 21(S2), 598–610. (Scopus: CiteScore 2021 – 2.0, SNIP – 0.667, SJR – 0.293) https://doi.org/10.15159/ar.23.030 .
- TRAPINA, D. Kairisa, N. Paramonova, Feed efficiency indicators and hormones related to nutrient metabolism in intensive fattened lambs of sire rams of different sheep breeds in Latvia. Agronomy Research, 2023, 21(S2), 611–622 (Scopus: CiteScore 2021 – 2.0, SNIP – 0.667, SJR – 0.293) https://doi.org/10.15159/ar.23.031 .
Ir sagatavots un iesniegts publicēšanai Latvijas Lopkopim popularzinātniskais raksts, kura publicēšana ir paredzēta 2023. gada augusta numurā.
Ceturkšņa ietvaros ir aizstāvēti divi kursa darbi, kuru ietvaros tika izmantoti dati no konkrētā projekta.
Ceturkšņa ietvaros ir pilnībā pabeigta 2023. gada jēru grupas izveide. Kopumā A23 jeb 2023. gada grupā ir nobaroti 92 jēri, kuriem ir paņemtas asinis priekš DNS un RNS izdalīšanas un bioķīmiskās analīzes. Attiecīgi sadarbības līguma ietvaros ir saņemti visi bioķīmiskās analīzes rezultāti.
Turpinās darbs pie 2022. gada kolekcijas paraugu RNS un mitohondriāls DNS kopiju analīzēm. Ir pabeigtas references gēna un 4 no 10 gēnu ekspresijas analīzes.
Pirmās grupas jeb A22 (2022. gada grupai) asociācijas analīze ir pilnībā pabeigta 7 no 10 gēniem. Pilnīga asociācijas analīze nozīmē, ka visiem konkrēto gēnu polimorfismiem, kuri tika novirzīti asociācijas analīzei, ir veikta saistību analīze ar 23 pazīmēm visu jēru grupā, izdalot Latvijas tumšgalves jērus. Tālākai analīzei jeb barības efektivitātes prognozes algoritma izveidei tiek virzīti tie polimorfismi, kuriem ir konstatēta statistiski ticama saistība ar kādu no barības efektivitātes rādītājiem vismaz vienā no analizētajām grupām. Šobrīd ir konstatēti vismaz 57 lokusi 7 gēnos, kuriem tiek izstrādātas genotipēšanas metodika.
Projekta dalībnieki ceturkšņa ietvaros piedalījās Latvijas aitu asociācijas rīkotajās Aitu dienās Rūjienā teķu konstroles nobarošanas stacijā Klimpas. Pasākumā tika prezentēti pirmie rezultāti, lai aitu audzētājiem skaidrotu projekta mērķi un iegūtos un plānotos rezultātus.
Kā arī projekta dalībnieki prezentēja trīs postera prezentācijas V Pasaules latviešu zinātnieku kongresā “Zinātne Latvijai”:
- Analysis of feed efficiency of offsprings of sire rams of the Latvian dark-headed breed.
- Analysis of feed cost and meat profit depending on the feed efficiency indicators in case of intensive fattening of Latvian dark-headed lambs.
- Association of polymorphisms in CAST gene with feed efficiency indicators and other parameters of intensive fattening in Latvian dark-head sheep.
Žurnāla “Latvijas Lopkopis” augusta numurā (http://new.llkc.lv/lv/nozares/lopkopiba/zurnala-latvijas-lopkopis-augusta-numura-5 ) ir publicēts populārzinātniskais raksts, kurā tiek sniegts ieskats barības efektivitātes rādītājos un projekta pirmā gada Latvijas tumšgalves jēru rezultātos.
Ceturkšņa ietvaros ir uzsākts darbs pie jaunas zinātniskās publikācijas, kas sniegs ieskatu barības efektivitātes rādītāju ekonomiskajai nozīmei aitu audzēšanā. Ir plānots no konkrētā zinātniskā raksta veidot populārzinātnisko rakstu par to pašu tēmu.
Ceturkšņa ietvaros ir pilnībā pabeigts A22 jeb 2022. gada jēru DNS paraugu rezultātu asociācijas analīze visiem 10 gēniem. Ir konstatētas ap 110 polimorfismi, kuriem ir statistiski nozīmīga saistība ar kādu no septiņiem barības efektivitātes indikatoriem. Projekta viens no pamatmērķiem ir izveidot algoritmu, lai noteiktu barības efektivitātes līmeni uz aptuveni 6 mēnešu vecumu, pirms jērs ir sasniedzis šo vecumu.
Ņemot vērā projekta finanšu sadalījumu, tika pieņemts lēmums atlasīt katram indikātoram desmit (10) variācijas ar visaugstāko statistiski nozīmīgo saistību, lai veiktu A23 jeb 2023. gada jēru DNS genotipēšanu. Kopumā pēc rūpīgas atlases tika atlasītas 68 variācijas, kurām tika izstrādātas genotipēšanas metodikas, ņemot vērā gan projekta finansējumu, gan molekulārās iespējas. Attiecīgi tika veikti nepieciešamie iepirkumi un darbu plānojumi.
Pēc asociācijas analīzes pabeigšanas, statistiski nozīmīgajiem polimorfismiem ir uzsākta bioinformātiskā analīze, lai veidotu datu bāzi par konkrētajiem polimorfismiem. Šī datu bāze tiks izmantota zinātnisko publikāciju sagatavošanai.
No projekta sadarbības partneriem ir saņemta apkopota informācija par A23 jeb 2023. gadā nobarotajiem jēriem, lai informāciju varētu izmantot izstrādāto algoritmu pārbaudei. Visiem paraugiem ir veikti barības efektivitātes indikātoru aprēķini.
Ceturkšņa ietvaros ir pabeigta un iesniegta žurnālā Agricultural Economics zinātniskā publikācija par iespējamo ekonomisko nozīmīgumu barības efektivitātes indikatoru selekcijai.
Kā arī ir iesniegts un saņemts apstiprinājums diviem abstraktiem uz “Biosystems Engineering 2024” konferenci 2024. gada maijā Tartū, Igaunijā. Uz abu abstraktu bāzes tiks veidotas zinātniskās publikācijas rakstu kopumam konferences ietvaros.
Ceturkšņa beigās tika organizēta projektā iesaistīto pušu (LU un LBTU) pārstāvju tikšanās, lai pārrunātu jau sasniegtos rezultātus un pēdējā gadā veicamo darbu plānu, lai pilnībā sasniegtu izvirzītos mērķus.
Ceturkšņa ietvaros ir veikta aptuveni 80% no atlasīto SNP manuālā genotipēšana A23 jeb 2023. gada jēru DNS paraugiem. Tādejādi ir uzsākta molekulāro marķieru paneļa pārbaude.
Projekta vadītājai un galvenajai izpildītājai ir bijušas vairākas tikšanās ar Latvijas Universitātes Zināšanu un tehnoloģiju pārneses centra darbiniekiem, lai pārrunātu projektā paredzēto 15 tehnoloģiju jeb zinību (licencēšanas process) un viena patenta jeb validējama intelektuālā īpašuma iesniegšanas procedūru. Attiecīgi ir uzsākta dokumentu sagatave, lai līdz projekta beigām būtu realizēti paredzētie rezultāti.
Abiem abstraktiem, kas tika iesniegti uz “Biosystems Engineering 2024” konferenci 2024. gada maijā Tartū, Igaunijā, ir sagatavota un iesniegta pilna publikācija, kas konferences ietvaros tiks publicēta. Uz abu abstraktu bāzes tiks veidotas zinātniskās publikācijas rakstu kopumam konferences ietvaros žurnālā “Agronomy Research”.
Žurnālā Agricultural Economics iesniegtā zinātniskā publikācija par ekonomisko nozīmīgumu barības sagremošanas efektivitātes indikatoru aitu selekcijā ir izgājusi divus recenzijas etapus un ir nopublicēta:
Trapina, I., Kairisa, D., & Paramonova, N. (2024). Analysing the Cost of Concentrated Feed and Income from Meat in Relation to Relative Growth Rate and Kleiber’s Ratio in Intensive Fattening of Latvian Dark-Headed Lambs. Agriculture, 14(4), Article 4. https://doi.org/10.3390/agriculture14040593
Ceturkšņa ietvaros ir sagatavoti un iesniegti divi abstrakti EAAP ikgadējā konferencē, kas ir plānota septembrī 2024. gadā. Ir iesniegts viens abstrakts uz mutisku prezentāciju un viens abstrakts postera prezentācijai.
Tika iesniegts abstrakts un projekta vadītāja, kā arī projekta sadarbības partnera projekta vadītāja, piedalījās ar mutisku prezentāciju Latvijas Biozinātņu un tehnoloģiju universitāte Lauksaimniecības un pārtikas tehnoloģijas fakultātes rīkotā zinātniski praktiskā konferencē "Līdzsvarota lauksaimniecība 2024".
Ir uzsākta viena starptautiskā projekta sagatavošana, kura ietvaros ir izveidota darba grupa ar kolēģiem Lietuvā un Igaunijā, kā arī tiek gatavoti jaunā Latvijas Zinātnes padomes (turpmāk - LZP) fundamentālo un lietišķo pētījumu projektu (turpmāk – FLPP) uzsaukumam paredzētie projektu apraksti. LZP FLPP ir paredzēts iesniegt, lai turpinātu konkrētās tēmas jeb aitu kvalitātes uzlabošanas iespēju pētniecību.
Paralēli ikdienas zinātniskajam darbam ir uzsākta divu bakalaura darbu un viena kursa darba sagatavošana, izmantojot projekta ietvaros iegūtos rezultātus.
Ceturkšņa ietvaros ir pabeigta atlasīto polimorfismu manuālā genotipēšana A23 jeb 2023. gada jēru DNS paraugiem. Balstoties uz abu gadu paraugu rezultātiem ir veikta asociācijas analīze.
Turpinās darbs pie iegūto rezultātu tehniskās un statistiskās apstrādes un sagatavošana publicēšanai.
Sadarbībā ar Latvijas Universitātes Zināšanu un tehnoloģiju pārneses centra darbiniekiem turpinās darbs pie intelektuālā īpašuma aizsardzības dokumentu sagatavošanas. Šī ceturkšņa ietvaros ir sagatavoti un iesniegti dokumenti Latvijas Patentu valdē uz intelektuālā īpašuma aizsardzību. Papildus norit darbs pie zinātību dokumentu sagatavošanas.
Ceturkšņa ietvaros projektā iegūtie rezultāti ir prezentēti:
- Latvijas Universitātes 81. zinātniskās konferences Bioloģijas institūta sēdē “Innovative and Applied Research in Biology” – divas mutiskās prezentācija;
- “Biosystems Engineering 2024” – divas postera prezentācijas.
Pēdējās konferences ietvaros ir paredzētas divas publikācijas, kurām ir veiktas korekcijas atbilstoši žurnāla recenzentu ieteikumiem. Sadarbība ar recenzentiem ir rezultējusies ar abu zinātnisko publikāciju akceptēšanu un darba turpināšanu ar žurnāla redakciju, lai sagatavotu pēdējās korekcijas.
Ir saņemts akcepts no EAAP ikgadējās konferences organizatoriem par vienas mutiskās un divām postera prezentācijām, tādejādi ir uzsākts darbs pie prezentāciju sagatavošanas.
Ceturkšņa ietvaros Latvijas Universitātes Bioloģijas fakultātē ir aizstāvēts bakalaura darbs ar projekta ietvaros iegūtajiem rezultātiem.
Balstoties uz projekta ietvaros iegūtajiem rezultātiem, ir uzsākta sadarbība konsultāciju un iespējams kopīgu publikāciju līmenī EURIZON projekta ietvaros ar Ukrainas Nacionālās lauksaimniecības zinātņu akadēmijas (National Academy of Agricultural Sciences of Ukraine) zinātniekiem.
Sadarbībā ar biedrību „Latvijas Aitu audzētāju asociācija” 2024. gadā turpinās jēru asins paraugu kolekcijas veidošana un nobarošanas datu uzkrāšana, kas tiks izmantoti turpmākai pētniecībai un promocijas darbu sagatavošanai.
Ceturkšņa ietvaros ir pabeigta abu gadu paraugu rezultātu asociācijas analīze un apkopoti rezultāti, lai izveidotu projekta ietvaros paredzētās datu bāzes, kas tiks publicētas Zenodo datu bāzē.
Sadarbībā ar Latvijas Universitātes Zināšanu un tehnoloģiju pārneses centra darbiniekiem ceturkšņa ietvaros ir pabeigta iesniegtā patenta licencēšanas process un izsludināt izsole ar izsoles datumu 15.11.2024. Vispārīgā informācija: https://www.zpc.lu.lv/fileadmin/user_upload/LU.LV/www.lu.lv/ZPC/LU-2024-006/LU-2024-006.pdf
Papildus norit darbs pie 14 zinātību dokumentu sagatavošanu.
Ceturkšņa ietvaros projekta dalībnieki piedalījās EAAP ikgadējā konferencē un prezentēja:
- postera prezentāciju: I. Trapina, S. Plavina, N. Krasnevska, J. Paramonova, D. Kairisa, N. Paramonova. Sequencing of the GHRL gene by NGS reveals a multi-SNP cluster associated with feed efficiency. Book of Abstracts No.34 of the 75th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Florence, Italy, 2024, pp. 170
- Mutisku prezentāciju: I. Trapina, S. Plavina, N. Krasnevska, J. Paramonovs, D. Kairisa, N. Paramonova The genotypes of Myostatin gene are associated with weight gain indicators of intensively fattened lambs of Latvian sheep. Book of Abstracts No.34 of the 75th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Florence, Italy, 2024, pp. 291
- Postera prezentāciju: D. Kairiša, L. Šenfelde, D. Bārzdiņa, I. Trapiņa, N. Paramonova, I. Miķelsone, H. Eglīte, V. Leska. Slaughter results and evaluation of carcass quality of meat-type breed lambs in Latvia. Book of Abstracts No.34 of the 75th Annual Meeting of the European Federation of Animal Science, Florence, Italy, 2024, pp. 652
Ceturkšņa ietvaros ir saņemta informācija par divu rakstu publicēšanu žurnālā “Agronomy Research”:
- Trapina, I., Plavina, S., Krasņevska, N., Paramonovs, J., Kairisa, D., & Paramonova, N. (2024). MSTN gene polymorphisms are associated with the feed efficiency of fattened lambs in Latvian sheep breeds. Agronomy Research, 22, xxx–ccc. https://doi.org/10.15159/AR.24.070
- Trapina, I., Plavina, S., Krasņevska, N., Paramonovs, J., Kairisa, D., & Paramonova, N. (2024). IGF1 and IGF2 gene polymorphisms are associated with the feed efficiency of fattened lambs in Latvian sheep breads. Agronomy Research, 22, xxx–ccc. https://doi.org/10.15159/AR.24.055
Papildus ir iesniegts jauna zinātniskā publikācija SCOPUS Q1 līmeņa žurnālā “Animal” un populārzinātniska publikācija Latvijas žurnālā “Saimnieks”.
Sadarbībā ar biedrību „Latvijas Aitu audzētāju asociācija” 2024. gadā turpinās jēru asins paraugu kolekcijas veidošana un nobarošanas datu uzkrāšana, kas tiks izmantoti turpmākai pētniecībai.